1、幼樹期修剪：在給柚子樹樹苗定植之後，我們便要在其嫁接口大約35厘米左右的位置處，將其剪截定幹。當柚子樹抽梢之後，再選留三個左右生長健壯、分佈均勻且互相之間有間隔的新梢作為主枝，將多餘的抹除。當主枝頂端生長到40cm左右的時候，做好摘心打頂工作。然後再在主枝上選留3個左右的健壯分枝左右副主枝。其中主枝與副主枝要保留一定的間隔，保證分生側枝能夠接受到充足的光照。然後對於一些交叉重疊以及擾亂樹形的枝芽也要及時抹除。
2、結果期修剪：柚子樹在結果的時候，一般是內膛枝結果力比較強的。所以對於初結果樹來說，修剪力度要輕，不可重剪。通常隻對一些生長位置不宜過長枝條以及病蟲害枝條剪除即可，保留較多的內膛枝，不可對結果母枝修剪。對於成年樹來說，因為樹冠已經是基本成型瞭，所以主要修剪對象為骨幹枝上的側枝以及其它枝梢。這樣修剪則主要是為保證柚子樹的生長和結果能夠平衡進行。對於強樹來說，要適當重剪，減少短剪，疏除一些生長過長過密的枝條，保留一些下垂枝，提高果樹的花果量。然後長勢較弱的樹，要以去弱留強為修剪原則，多保留葉果枝。
3、衰老時期修剪：當柚子樹開始進入到衰老時期的時候，應在春梢生長前後以及5-6月的時候進行。對於老樹修剪，要以露骨修剪為主，在更新枝條的時候，保留適量的主枝與副主枝。對於樹冠上4年內生的側枝要將其全部剪除，樹冠上不可保留葉片，保證強梢的生長。然後在萌芽更新之後，再做好抹芽控梢工作。大約兩年左右便可形成一個新的樹冠，重新結果。最後對於一些仍然有著結果能力的衰退枝條，可以適當進行輪換更新，在三年內全部更新完畢。
