1、物理方法，物理方法主要是指疏挖底泥、機械除藻、引水沖淤和調水等。疏浚污染底泥意味著將污染物從(河道)系統中出處理去。可以較大程度地削減底泥對上覆水體的污染貢獻率，從而改良水質。調水的目的是通過水利設施(如閘門、泵站)的調控引入污染河道上遊或附近的清潔水源以改良下遊污染河道水質。此類方法往往治標不治本。
2、化學方法，化學方法如混凝沉淀、加入化學藥劑殺藻、加入除磷劑推動磷的沉淀、加入氨氮去除劑脫氮等方法。研究表明，這種方法對濁度、COD、SS、TP去除效果較好，對TN、重金屬等也有一定的去除效果，日藥劑用量少。
3、生態--生物法
（1）河道曝氣法，人工曝氣復氧是指向處於缺氧(或厭氧)狀態的河道進行人工充氧以增強河道的自凈能力，改良水質、改良或恢復河道的生態環境。河道曝氣復氧一般采用固定式充氧站和移動式充氧平臺兩種形式。該工藝具有設備簡單、機動靈話、安爭可靠、投資省、見效快、操作便利、適應性廣、對水生生態不產生任何危害等優點，適合於城市景觀河道和微污染源水的治理。
（2）生物膜技術，生物膜技術是指使微生物群體附著於某些載體的表面上呈膜狀，通過與污水接觸，生物膜上的微生物攝取污水中的有機物作為營養吸收並加以同化，從而使污水得到凈化。目前，常用於河道污水治理的生物膜技術主要有接觸氧化法、生物活性炭填充柱凈化法、薄層流法和伏流凈化法，用得比較多是接觸氧化法。
（3）生物修復技術，生物修復技術是指利用微生物及其他生物，將水體或土壤中的有毒有害污染物質現場降解為CO2和H2O，或轉化為無害物質的工程技術系統。用於河道污水治理的生物修復技術主要有兩類。一類是直接向污染河道水體投加經過培養篩選的一種或多種微生物菌種，試驗證明COD去除率可達90%以上。另一類是向污染河道水體投加微生物促生劑(營養物質)，推進“土著”微生物的生長。投放藥劑後，通過促生作用，推進污染物降解微生物的生長，河道中微生物由厭氧向好氧演替，生物由低等向高等演替，生物的多樣性不斷增加，使污染水體的BOD5，COD迅速下降，溶解氧明顯上升，黑臭處理。這種方法對於處理水體黑臭、增加水體溶解氧作用明顯。
（4）土地處理技術，土地處理技術是一種古老、但行之有效的河道污水治理技術。它是以土地為處理設施，利用土壤、植物系統的吸附、過濾及凈化作用和自我調控功能，達到某種程度的凈化目的。國外的實踐經驗表明，土地處理系統對於有機化合物尤其是有機氯和氨氮等有較好的去除效果。
（5）水生植物凈化法，該方法是充分利用水生植物的自然凈化機能的污水凈化方法。例如采用浮萍、濕地中的蘆葦等在一定的水域范圍進行凈化處理。但是生活污水的排入會產生臭氣、害蟲和景觀影響等問題，因此選用時要綜合考慮上述問題，如選擇在春夏季下風口的位置種植蘆葦等。
