1、這是一個未來的科幻故事，主角不是阿泰爾，是一個叫戴斯蒙德·邁爾斯的酒吧服務生，阿泰爾是他的祖先，邪惡的Abstergo試圖把他在基因裡關於阿泰爾的記憶提取出來（目的是尋找古代神器的下落），最關鍵的一段記憶無法提取，說是被Desmond的潛意識擋住，所以隻能讓他回想之前和之後的事刺激他想起那段記憶，因此遊戲都是Desmond的夢境，或者說是關於以前他祖先阿泰爾的記憶。
2、古代聖堂騎士和刺客部落的爭鬥一直延續至今，戴斯蒙德·邁爾斯作為刺客後代一員被Abstergo公司綁架後逼迫其回憶祖先的記憶（此公司由聖堂騎士的後代組成，為達目的卻不擇手段；他們試圖通過控制人類的意識和殺掉那些不被他們能力影響的人，讓世界得到和平。），公司的目的是找到一種叫伊甸園碎片的神器，並試圖查出其它幾個碎片的位置，這種神器有很多個，記憶中阿泰爾的師父Mualim在遊戲一開始得到的那個東西就是其中之一，這種神器的力量是給人幻覺（精神控制，統治世界的關鍵手段），公司的原計劃是試用利用主角來找尋和取得那些遠古神物。然後它們發射到太空中，在低軌道上運行並替所有人洗腦。
3、但阿泰爾和戴斯蒙德·邁爾斯作為刺客部族有一種特殊的能力，就是看穿一切幻覺和謊言，所以整個遊戲Mualim在控制阿泰爾的時候困難重重，阿泰爾也幾次在任務中質疑任務本身，最終阿泰爾自己悟出（不是完全自己悟出，有一些人的幫助）真相，遊戲終章和Mualim決鬥，Mualim再次試圖用神器控制阿泰爾，結果還是沒有鷹之視野強大，最終失敗。
